Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms