Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRZ1P23471 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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