Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms