Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GCSHP23434 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GCSHP23434 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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