Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF1P22415 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF1P22415 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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