Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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