Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFE3P19532 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms