Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms