Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms