Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSPP15924 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms