Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRAFP15056 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms