Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms