Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
IFITM1P13164 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms