Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms