Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms