Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD1P0DJD0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms