Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms