Protein–RNA interactions for Protein: P0C870

JMJD7, JmjC domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD7P0C870 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JMJD7P0C870 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JMJD7P0C870 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms