Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPBP07199 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPBP07199 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms