Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA4P06727 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA4P06727 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms