Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHEP01854 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHEP01854 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms