Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IGKV1-17P01599 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms