Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms