Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms