Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNMO15061 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNMO15061 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNMO15061 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNMO15061 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms