Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1AO15047 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1AO15047 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms