Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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