Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms