Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms