Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35F4A4IF30 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms