Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms