Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN3Q9UPQ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms