Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms