Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG3Q9UJ98 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG3Q9UJ98 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms