Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms