Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms