Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms