Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABI3Q9P2A4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms