Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms