Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms