Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms