Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms