Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms