Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30AQ9NV96 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms