Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms