Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms