Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRN4Q9NRL3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms