Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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