Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms