Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms